勝手に閉じない
なんでや、こないだまで閉じてたじゃん＞＜。
対処
正しいのかはわからないけど、破壊的な変更をmsys2に加えてないから良しとします。
適当にショートカットのプロパティを開く。
リンク先を変更。
C:\Windows\System32\cmd.exe /A /Q /K C:\msys64\mingw64_shell.bat
を
C:\Windows\System32\cmd.exe /A /Q /C C:\msys64\mingw64_shell.bat
こうする。
簡単だったね！